2024/09/28 @國際
從過去以來,微生物、土壤等各個領域的專家一直從各自的角度探索提高作物品質和產量的方法。這是屬於「垂直型」研究,而多組學分析(multi-omics)則結合了不同領域的橫向研究,做為農業大數據的分析有相當大的應用潛力。
示意圖
多組學的數據分析的特色在於集結不同項目的數據。以大豆栽培來說,目前已收集了超過一萬筆以上各種生長面向的數據,例如,應用栽培條件和氣象數據於大豆的多組學分析。其他像是大豆產量和蛋白質含量、基因表現、化學物質(代謝物),以及土壤和根部周圍微生物,如菌根真菌和細菌,土壤pH 值和氮含量,磷和鉀含量等化學特性,以及土壤顆粒大小和保水性等物理特性皆能含括在內。【延伸閱讀】- 棕櫚科多組學綜合分析數據庫
圖一、多組學的數據分析項目
透過上述項目數據再加上機器學習(LiNGAM)來說明數據間的因果關係,就能進而掌握大豆產量與品質等作物特性。目前的研究分析結果顯示,左右大豆產量的因素中,以氣象(10%)為最高,其次是土壤物理性(7%),最後是生產者農事方式。雖然這項結果與過去模式類似,卻是首次以具體數據方式來證實結果。另外一個案例是小松菜。依照過去經驗,如須提升小松菜的產量,則糖度品質則會下降,若提升品質則必須在產量上有所取捨。若透過多組學的數據分析則可掌握糖度與品質之間關係,尋找出讓兩者之間平衡關鍵因素,進而改善這項問題。
除此之外,目前利用數據在虛擬空間做出栽培模擬情境(數位孿生),可讓大豆栽培在未來可提前做出生產前預測。另外為了提升預測精準度,在過去採用的是以過程為基礎的模型(process-based model),現在可以利用數據發展出機器學習模型,透過這兩個管道可以掌握過去模式所無法預測出的項目。
圖二、.數位孿生農業運作模式
在經濟層面上,即使收穫了大量的優質大豆,但如果無法獲利,就無法讓農民真正帶來實質效益,如果發生產銷失衡狀況,廢棄大豆無論是在運輸成本或是在環境上都會造成一定負荷。此時,就可以應用多組學的數據分析,集結從大豆生產到消費者階段相關數據,將情境數據化。
目前日本的國家級研究機構理化學研究所(RIKEN)在內閣府射月型研發計畫(Moonshot Research and Development. Program)的支持下進行相關研究,並已開發一套系統集結產量、品質、出貨預測,包括產地與品種等相關即時資訊在內,讓生產決策與收益間達到最佳化。
圖三、預測數據即時傳送畫面
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