一、103中綱計畫農糧科技研發領域
(一)作物生產關鍵生物技術
(二)農藝作物科技
(三)園藝作物科技
(四)種苗及植物品種保護技術暨種原保育及利用
(五)安全農業科技
二、103中綱計畫科技管理科技發展領域
(一) 建立農業科技前瞻決策支援體系
(二) 落實農業科技研發成果結合產業創新
(三) 設置農業科技研究院整併台灣動物科技研究所之動物科技產業化能量
三、103中綱計畫防疫檢疫科技研發領域
(一)動物防疫檢疫及屠宰衛生技術之開發
(二)植物防疫檢疫技術之開發
四、103中綱計畫坡地防災與生態系復育科技研發領域
(一)坡地防災暨警戒科技研發
(二)退化生態系之復育
五、103中綱計畫森林及生物多樣性研究領域
(一)永續林業生產試驗研究
(二)森林及生物多樣性經營利用
六、103中綱計畫畜牧業科技研發領域
(一)家畜育種生產技術及品質改進
(二)家禽育種生產技術及品質改進
(三)飼料、牧草品質及檢測技術提升
(四)畜牧生產自動化及污染防治
(五)種畜禽產業研究應用
(六)畜產關鍵生物技術研發與應用
(七)畜產生物與遺傳資源保存與利用
(八)動物保護及人道管理：改善動物福祉之畜禽產品生產及建立與評估動物人道管理模式
七、103中綱計畫漁業科技研發領域
(一)加強遠洋漁業資源合理利用及管理
(二)強化沿近海漁業資源養護管理與合理利用
(三)優質養殖漁業及水產品安全
八、103中綱計畫食品科技研發領域
(一)開發新穎食品及優良農產品相關技術及資訊
(二)開發保健食品
(三)開發國產大宗農產品多元化加工技術
(四)開發國產大宗水產品多元化加工技術
(五)開發國產大宗畜產品多元化加工技術
(六)農業及食品微生物種原拓展加值利用與條碼資料庫建立
九、103中綱計畫生物技術產業化領域
(一)基因轉殖與非基因轉殖植物種苗檢監測技術及共存體系之建構
(二)農業生技技術創新與產業資訊推廣
(三)強化農業科技園區研發及農企業技術提昇
十、103綱計畫農業電子化領域
(一)推動智慧農業物聯網
(二)打造農業數位多元服務
(三)強化農業源頭管理資訊服務
十一、103綱計畫國際合作領域
(一)動植物防疫檢疫
(二)植物產業與環境
(三)動物產業與環境
(四)國際農業科技政策及人才培育
十二、103綱計畫農業環境領域
(一)土壤資訊在農田土壤管理、施肥技術應用研究
(二)開發微生物肥料，降低肥料資材耗用
(三)保護農業生產環境，發揮農業減碳功能
(四)因應農地活化之轉(契)作作物生產機械研發
(五)農業氣象災害發生機率估算及防護技術研發
(六)農業灌溉用水規劃與農田水利生態工程研發
(七)提昇農業土水資源利用及管理效率
(八)整合智慧型農業技術應用於重大農業施政計畫發展及彰雲地區果樹節水栽培技術發展與灌溉需水量之研究。
十三、103綱計畫農業政策與農民輔導科技發展領域
(一)農業產業發展政策研究
(二)農業創新與推廣管理研究
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