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法國國家食品與環境研究院(INRAE)的一項國際合作研究，調查了來自全球超過3,400個栽培與野生茄子品種的收藏後，發表茄子的完整基因組(泛基因組)與農藝性狀(泛表型)，鑑定出超過20,000個基因家族及218種農藝性狀，包含抗真菌萎凋病與抗氧化能力等，此項綜合性資料集涵蓋了該物種內所有已知的基因變異，包括與刺毛發育等性狀相關的基因。
泛基因組代表一個物種內的完整基因庫，包含個體間所有可能的變異，在茄子等作物中，這些變異是數千年來人類選育的結果，研究人員花費八年多時間，調查了超過3,400個栽培茄子品種及其野生近緣種，包括現代與古老栽培品種、地方品種與野生物種等，其中近700個品種來自INRAE位於亞維儂的蔬菜生物資源中心，而研究團隊檢測了368個具代表性的茄子品種，以及兩個野生祖先種：刺茄和非洲茄，研究人員對每個品種進行基因組定序，並在田間研究218種農藝性狀，包括抗旱性、抗病性及果實成分等。
透過尖端生物資訊分析，研究人員確定茄子基因組包含16,300個「核心」基因家族及4,000個「選擇性」基因家族，前者所有品種都具有，後者則僅存在於特定品種中，某部分性狀在所有田間試驗中皆可觀察到，有些則僅出現在特定地區，顯示部分性狀受環境影響較大。研究中展示超過3,000個農藝性狀與基因之間的關聯，並在多數情況下確認了造成這些性狀的DNA突變，研究特別聚焦於三個關鍵性狀及其相關基因：抗鐮刀菌萎凋病(嚴重影響茄子產量的真菌病害)、異綠原酸含量(具健康益處的抗氧化物質，但也與果實苦味和褐變有關)及刺毛形成，其餘215種性狀將於未來發表。
全球茄子年產量近6,000萬噸，這項完整基因與農藝性狀資料集報告發表是一項重大進展，不僅有助於深入了解茄子的演化歷史，也能協助育種人員因應未來挑戰培育出適應當地環境、氣候限制、特定農業操作方式及消費習慣的客製化茄子品種，該研究進一步強調保存遺傳多樣性的重要性，並彰顯生物資源中心在推動植物遺傳學研究與形塑未來農業的關鍵角色。
茄子的「泛基因組」指的是該物種內所有栽培與野生茄子所擁有的完整基因庫，涵蓋不同品種之間所有已知的基因變異；「泛表型」則是對應這些基因變異，在田間可觀察到的完整農藝性狀集合。 本研究調查超過 3,400 個來自全球的栽培與野生茄子品種，建立了包含 超過 20,000 個基因家族與 218 種農藝性狀的綜合性資料集，完整收錄了與抗病性、抗氧化能力及刺毛發育等性狀相關的基因變異。
透過生物資訊分析，研究人員將茄子基因家族分為兩類： 核心基因家族（16,300 個）：存在於所有受研究的茄子品種中，代表該物種的基本遺傳結構。 選擇性基因家族（約 4,000 個）：僅存在於特定品種中，與品種間性狀差異高度相關。 這樣的分類顯示，部分農藝性狀是所有茄子共有的，而部分性狀則與特定基因組變異及環境條件密切相關，為育種人員提供精準的基因選擇依據，以培育符合不同地區與需求的茄子品種。
研究中展示了 超過 3,000 個農藝性狀與基因之間的關聯，並在多數情況下確認了造成性狀差異的 DNA 突變。其中，研究特別深入分析了三個關鍵性狀： 抗鐮刀菌萎凋病：一種嚴重影響茄子產量的真菌病害。 異綠原酸含量：具有健康益處的抗氧化物質，同時影響果實苦味與褐變。 刺毛形成：與果實外觀與操作便利性相關的重要性狀。 其餘 215 種農藝性狀的詳細基因分析，將於未來研究中陸續發表。
