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最新遺傳研究全面揭示西瓜的遺傳密碼

2019/11/13 @國際

摘要

北京市農林科學院蔬菜研究中心研究團隊針對西瓜的遺傳特徵進行更深入的研究,以次世代定序的方式重新定序7個西瓜、共414個個體全基因體資訊,也發現過往育種者將西瓜與野生種反覆雜交後,獲得可抗線蟲、耐旱、抗病害的品系。

示意圖

最新遺傳研究全面揭示西瓜的遺傳密碼

  現在被人們所熟知的西瓜(cultivated watermelon, Citrullus lanatus)之所以果實飽滿且香甜係因農民長時間選育的結果。由於西瓜是各地常見的經濟作物,廣為全球栽培,且西瓜也是眾多消費者喜愛的商品,因此除了探討以外表性狀為主的傳統選育研究外,許多研究團隊也針對西瓜的遺傳特徵進行更深入的研究,並希望以基因體(genome)尺度進行較為全面的探討。中華人民共和國北京市農林科學院蔬菜研究中心(Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops (North China), Beijing Key Laboratory of Vegetable Germplasm Improvement, Beijing, China)與美國博伊斯湯普森研究所(Boyce Thompson Institute)的研究團隊重新將6個野生種在內共7種西瓜以次世代定序的方式重新定序,以獲得更完整的遺傳資料。

  研究團隊曾於2013年,以短序列片段定序技術(short-read sequencing)解出第一條西瓜參考基因體(first watermelon reference genome)。研究團隊根據先前的研究經驗,重新定出涵蓋7個物種共414個個體的全基因體資訊,並以此重建種間的演化關係。研究團隊也透過遺傳數據發現,育種者曾在過去20-30年間將現有的西瓜與野生種反覆雜交後,獲得可抗線蟲、耐旱、抗病害的品系。這樣藉由與野生種雜交的過程,也可望因應隨之而來的氣候變遷【延伸閱讀】北方玉米葉枯病的毒性基因標定與遺傳特性

  研究團隊根據現有的數據,也可重新還原西瓜種化歷程與育種的歷史,為後續育種提供強而有力的遺傳資料。

  該研究由美國農業部(United States Department of Agriculture)、中華人民共和國科學技術部(Ministry of Science and Technology)等機構資助。相關研究成果已發表在<Nature Genetics>。

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